يُمنح شخص وحيد في المدرسة الثانوية وظيفة بدوام جزئي طوال حياته باعتباره نينجا في العصر الحديث مكلفًا بتنفيذ اغتيالات دولية. بعد الحرب العالمية الثانية، طورت قيادة الحلفاء في اليابان وكالة جديدة للمساعدة في إدارة الإرهاب والعنف داخل منطقة المحيط الهادئ. كانت الوكالة مزودة بموظفين من النينجا وكُلفوا في البداية بمعالجة الشؤون الداخلية. في نهاية المطاف نما هذا البرنامج إلى شكله الحالي، حيث قام بإدارة 20000 نينجا عبر مجموعة من الشؤون المحلية والدولية. أحد هؤلاء النينجا هو “كودو”. الفاشل في المدرسة الثانوية والبالغ من العمر سبعة عشر عامًا، يستعد الآن ليكون خط الدفاع التالي ضد زيادة محتملة في القتلة الأجانب الذين يغزون طوكيو.